由于医学专业本身的特殊性，绝大多数国家都是限制外国人申请临床医学专业，因此很多情况下国际生只能选择药学、保健或营养学等学科。日本却是为数不多的可以接受临床医学专业的国家，随着赴日留学专业中医学生的比例逐年攀升，竞争十分激烈。

自1901年迄2021年的诺贝尔奖颁发历史中，日本是欧美之外获奖最多的国家，达29人，进入21世纪后甚至仅次于美国居世界第二。日本人斩获的诺奖中，生理学或医学奖5人。多数诺贝尔奖得主是大学的教授或研究者，日本的医学高等教育及基础医学研究水平之高由此可见一斑。

 基础医学：是研究人的生命和疾病现象的本质及其规律的自然科学。

 学科包括：解剖学和组织学，生理学，病理学，疾病学，微生物学，生化学，药理学，免疫学等

 临床医学：教授基础医学、临床医学的基本理论和医疗预防的基本技能；培养能在医疗卫生单位、医学科研等部门从事医疗预防、医学科研等方面工作的医学高级专门人才。

 社会医学：社会医学是从社会学角度研究医学问题的一门学科。

 保健学：以探求如何增进、保持健康为目的的诸学科的总称。

 看护学：研究领域集中在护理管理、护理教育、护理药械、缓和护理、中医护理、康复护理、护理伦理、医院感染控制、社区健康护理、急救护理、老年护理学、护理评估等方面。

 营养学：是研究食物与机体的相互作用，以及食物营养成分（包括营养素、非营养素、抗营养素等成分）在机体里分布、运输、消化、代谢等方面的一门学科。

东京大学：因为医学部在日本成立的时间是最早的,所以医学专业的实力是很强的，尤其是东京大学，因为其他6所帝国大学的医学部都是在东大医学部的医生指导下，从江户时代到明治时期陆陆续续成立的。

京都大学：京大医学院的本科课程集中在是医学系和人类健康科学系。医学院的主要重点是帮助学生成为临床医生和医学专业人士，他们将在医疗保健，研究甚至教育领域担任首要专业人员。人类健康科学学院围绕“预防疾病，保持和促进良好健康以及提高病人和残疾人的高质量生活的研究”展开。

大阪大学：阪大医学院分为两个学院，分别称为医学院和联合健康科学学院。医学院可以选择参加一个为期6年的计划，如果成功完成，可以邀请毕业生攻读医学博士学位。

公立

 六医大：

日本国立六医大是由千叶大学，金泽大学，新潟大学，冈山大学，熊本大学及长崎大学6所学校组成。1919年《大学条例》的实施批准了这6所院校开设医学部，称为“旧六医科大学”、“旧六”、“六医大”等。

 东京慈惠会医科大学：东京慈惠会医科大学是日本私立的旧制大学中最古老的单科医科大学，当时只设立了医学院，以培养医师和看护师为目的。由学校法人慈惠大学运营。入学难度可与国公立大学相媲美。

 顺天堂大学：顺天堂大学于1838年建立，1946年开设大学教育的日本私立大学。以医学部为中心，由3学部5学科构成。私立大学医学部中，其授课费最便宜。