跨学科理念是伦敦帝国理工学院建设发展的重要指导理念。学校的专业建设专注于理、工、商学科的打造，注重优势学科的精细化发展，在形成学科群的基础上，纵深推动跨学科的成长与成熟。

帝国理工学院本科共设16个院系，下设工程学院、自然科学学院、医学院、商学院等：

工程学院下属10个院系：

航空航天系、生物工程系、土木与环境工程系、化学工程系、计算机系、Dyson设计工程学院、地球科学和工程学系、电气与电子工程系、材料科学和工程系、机械工程系；

医学院下属8个院系：

临床科学学会医学系、医学系、国家心脏和肺学会、公共卫生系（学院）、外科与肿瘤学系、李光前医学院伦敦办事处、帝国学院学术健康科研中心、帝国学院国家卫生服务信托；

自然科学学院下属5个院系：

数学系、物理系、化学系、生命科学系、环境政策中心；

商学院下属3个院系：

金融系、创新与创业（企业家）系、（工商）管理系，其中IC破天荒开设了一门商科本科专业--经济、金融与数据科学（2023），这也是英国首个经济学、金融学和数据科学的跨学科学位。