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SMCS | 高藤学子荣获IGEM全球银奖,团队总队长-William同学专访

2023-12-06发布于上海

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2023年,国际基因工程大赛(International Genetically Engineered Machine, 简称IGEM)在法国巴黎落下帷幕。这是一个全球性的竞赛,旨在推动合成生物学的发展和应用。我校的William同学在此次大赛中与来自全球的395个队伍展开激烈竞争,最终荣获IGEM全球银奖,这是对其科研能力和创新思维的高度认可。



IGEM简介
Introduction to IGEM -


iGEM即国际基因工程机器大赛,它创始于2003年,是由美国麻省理工学院(MIT)主办,合成生物学领域最高级别的国际性学术竞赛。



iGEM在全球范围内都有着极高的知名度和曝光度,iGEM的赛况以及研究成果,每年都会有专题报道刊登在《Science》、《Nature》等这样的顶级学术杂志上,像BBC这样的传统媒体也会关注比赛并且进行跟踪报道。iGEM是一个交叉学科的比赛,虽然以生物学为核心,但实际上涉及到包括生命科学、商科、经济学、传媒、计算机、艺术设计等各方面的能力。



William
高藤致远A2年级学生

IGEM竞赛团队总队长

负责整个队伍的实验进度的推进,以及干湿队之间的沟通协调和对接,需要从科研项目管理角度帮助团队完成竞赛并取得成绩。

IGEM竞赛不仅是一场学术竞技,更是一个合成生物学创新理念和技术的展示平台。William同学此次的课题是利用LbCas12a系统检测环境中的福氏耐格里阿米巴原虫(食脑虫)这是一种前沿的基因编辑技术,来检测环境中的阿米巴原虫(俗称“食脑虫”)。这种原虫在水体中生存,对公共健康构成威胁。William同学的研究不仅具有重要的实际应用价值,还展示了合成生物学在解决复杂生物安全问题中的巨大潜力





PART.01 / 社会价值>商业价值



我们的实验课题是利用LbCas12a系统检测环境中的福氏耐格里阿米巴原虫,即食脑虫。


在选择这个课题时,我们也有备选的课题,但是我们深入研究后发现,阿米巴原虫的的死亡率高达98%,更让人担忧的是,目前的医疗水平竟然没有特效药,能够有效地治疗这一寄生虫引起的疾病。



在确定了大方向后,我们深入了解了阿米巴原虫感染的实际情况,发现患者饱受病痛之苦,并且由于缺乏有效的治疗手段,病情发展迅速,对患者的威胁极大。


而且就目前来看,阿米巴原虫的病例较少,所以并没有特效药可以进行治疗,在发病时也没有有效的治疗方案。而我们选择做这个课题,在商业价值上可能并不占优势。但是除了商业价值之外,我们更应该关注到的是人道主义。


我们希望,我们此次的研究可以真正地帮助到这些病人,为他们做一些实事,所以我们决定选择这个课题。




PART.02 / 从零开始



虽然,William同学带领团队已经获得了银奖,但是,在参赛期间,很多东西几乎是从零开始。


在实验过程中,我们要使用到很多的大型实验器材,比如像是荧光定量PCR仪,PCR基因扩增仪等等仪器,这些仪器也只有在顶尖的高校实验室才能接触的到,那对于我们来说就是得全部重新学习。



除了实验仪器的使用之外,对于课题方面的了解我们也几乎是从零开始的,所以我们虽然有很多的想法但是这些想法是否是能落地的,我们不得而知。


所以为了验证我们的想法,学校的老师也帮我们联系很多跟课题相关的专家帮助我们,分析我们想法的落地性和操作难度,通过跟这些专家沟通,我们获得了更多的信息,并在学校老师的帮助下,切合实际的改进我们的计划。



PART.03 / 拼尽全力



IGEM作为全球性质的竞赛,含金量和难度不言而喻,但即便如此,William同学从来没有泄气,William同学也说过:"我们选择这个课题就是我们想为阿米巴原虫患病者要做一些实事,我们一定不能放弃。"



“我们希望在阿米巴原虫如此高的死亡率和特效药的匮乏,弗氏耐格里阿米巴原虫对人体的极高危害使其备受关注。进行水质监测,发现原虫污染的水源,消毒杀灭原虫,保障公众健康”

—实验目的


从四月份团队创建,我们除了一直在完善队伍体系,了解IGEM的相关比赛规则之外,还阅读了大量的海内外跟阿米巴原虫的相关论文。


尤其是在暑假,我们团队所有队员都一直在上海华东理工大学进行实验,在实验过程中,因为阿米巴原虫本身具有一定的危险性,所以我们只能提取两段较为安全的基因片段,分别是18-SRNA和GENOME来进行实验。而且在实验过程中我们所使用的溶液像是Lording buffer EB都是属于一级致癌物的,所以我们不仅要做好实验还要在实验的过程中保护好自己。


除此之外,生物实验具有不确定性,有些细菌总是会由于不明原因,全”菌“覆没导致我们两三天的努力都全部白费掉。



总的来说,虽然困难很多,但这些困难并没有阻止我们的探索精神,在实验过程中,我们不仅仅是在研究我们的课题,更是在面对挫折中培养了坚韧和毅力,每一次失败都是一次宝贵的经验,失败也让我们更加深刻的理解了学术实验的严谨性,复杂性和变数多端。




在实验过程当中的困难也促使我们更加谨慎和细致的进行每一步操作。对实验材料的选择,实验条件的控制都更加的慎之又慎。这种谨慎性不仅是对实验本身负责,也是对团队成员安全的保障,尤其是在处理危险性的生物材料时更是如此。

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